Jatko oli piristysruiske koko henkilökunnalle. Sen siivittämänä Kanavuoren Suojeluvarikolle myönnettiin laatujohtamisjärjestelmän sertifikaatti. Siinä todettiin laatujärjestelmän rakennetun AQAP 120 ja ISO 9002 pohjalle. Saavutettu laatusertifikaatti oli varikolle ja sen johdolle iso asia.
Kujanjuoksu päättyi vuoden 2001 selontekoon
Keväällä 2000 Materiaalilaitoksessa käynnistyi sisäinen suunnittelutyö, joka kosketti niin Suojeluvarikon tulevaisuutta kuin toimialan ja siihen kuuluvien muiden varikkojen kohtaloa. Rakennemuutos puolustusvoimissa alkoi jo 1980-luvun lopulla johtamisjärjestelmäuudistuksen ja materiaalilaitosvalmistelujen myötä. Se huipentui vuoden 2001 selontekoon, jonka keskeisin asia oli sodan ajan joukkojen vahvuuden pienentäminen 350 000 vuoteen 2008 mennessä.
Materiaalilaitoksen heinäkuussa 2001 julkaistun esikäskyn mukaan Suojeluvarikko lakkautettaisiin. Muutoksen toimeenpano oli selkeä: “Toiminnot siirretään muille varikoille tai ulkoistetaan ja alueesta luovutaan”. Näin tapahtui 31.12.2003, ja Kanavuoren Suojeluvarikko yhdistettiin Lievestuoreen Varikkoon.